NTML Nebraska Transposon Mutant Library Strain Primer Designer

10/2020 by Christopher F. Schuster.
No guarantee whatsoever. This includes accuracy, correctness, completeness and everything else. Use at you own risk and please do not come back to me if something didn't work out the way it should (have). Feeback is very welcome though and I will do my best to correct any mistakes I am made aware of.

This is the scratch pad. Hit <ENTER> on keyboard to save currently selected sequence to the scratch pad.
Hit the c button to clear selections.
Select text...

Gene name: SAUSA300_0870 NE strain: NE331 cgattttaaacaattagacctgaaaaaaataagacaattaacgaatgaagcattggaagaaattttacctaaagttcagtttaatttattaaattcttcagcttactatcgttatttatcaagacgcattggcgctattgtagaaacaacactaagcgcattaaaatatcaaggcacgtattcaaagtttatgccaaaacattttgagacaagttttagaaggaaaccaagaacaaatgacgaattaattgcacaaacattaacgacaactcaaggtattccaattaatattagagggcaaattgaccgtatcgatacgtatacaaagaatgatacaagttttgttaatatcattgactataaatcctctgaaggtagtgcgacacttgatttaacgaaagtatattatggtatgcaaatgcaaatgatgacatacatggatatcgttttacaaaataaacaacgccttggattaacagatattgtgaaaccaggtggattattatacttccatgtacatgaacctagaattaaatttaaatcatggtctgatattgatgaagataaactagaacaagatttaattaaaaagtttaagttgagtggtttagttaatgcagaccaaactgttattgatgcattggatattcgtttagaacctaaattcacttcagatattgtaccagttggtttgaataaagatggctctttgagtaaacgaggcagccaagtggcagatgaagcaacgatttataaattcatccaacataacaaagagaattttatagaaacagcttcaaatattatggatggacatactgaagttgcaccattaaagtacaaacaaaaattgccatgtgctttttgtagttatcaatcggtatgtcatgtagatggcatgattgatagtaagcgatatcgaactgtagatgaaacaataaatccaattgaagcaattcaaaatattaacattaatgatgaatttgggggtgagcaatagstartATGACAATTCCAGAGAAACCACAAGGCGTGATTTGGACTGACGCGCAATGGCAAAGTATTTACGCAACTGGACAAGATGTACTTGTTGCAGCCGCGGCAGGTTCAGGTAAAACAGCTGTACTAGTTGAGCGTATTATCCAAAAGATTTTACGTGATGGCATTGATGTCGATCGACTTTTAGTCGTAACGTTTACAAACTTAAGCGCACGTGAAATGAAGCATCGTGTAGACCAACGTATTCAAGAGGCATCGATTGCTGATCCTGCAAATGCACACTTGAAAAACCAACGCATCAAAATTCATCAAGCACAAATATCTACACTCCATAGTTTTTGCTTGAAATTAATTCAACAGCATTATGATGTATTAAATATTGACCCGAACTTTAGAACAAGCAGTGAAGCTGAAAATATTTTATTATTAGAACAAACGATAGATGAGGTCATAGAACAACATTACGATATCCTTGATCCTGCTTTTATTGAATTAACAGAGCAATTGTCTTCAGATAGAAGTGATGATCAGTTTCGAATGATTATTAAACAATTGTATTTCTTTAGCGTTGCAAATCCAAATCCTAAAAATTGGTTGGATCAATTGGTGACACCATACGAAGAAGAAGCACAACAAGCGCAACTTATTCAACTACTAACAGACTTATCTAAAGTATTTATCACAGCTGCTTATGATGCTTTAAATAAGGCGTATGATTTGTTTAGTATGATGGATAGCGTCGATAAACATTTAGCTGTTATAGAAGATGAACGACGTTTAATGGGGCGTGTTTTAGAAGGTGGCTTTATTGATA<<<TN<<<TACCTTATTTAACTGGTCACGAATTTGGCGCGCGTTTGCCTAATGTAACAGCGAAAATTAAAGAAGCAAATGAAATGATGGTCGATGCCTTAGAAGATGCTAAACTTCAGTATAAAAAATATAAATCATTAATTGATAAAGTGAAGAGTGATTACTTTTCAAGAGAAGCTGATGATTTGAAAGCTGATATGCAACAATTGGCGCCACGAGTAAAGTACCTTGCGCGTATTGTGAAAGATGTTATGTCAGAATTCAATCGAAAAAAGCGTAGCAAAAATATTTTGGATTTTTCTGATTATGAACATTTTGCATTACAAATTTTAACTAATGAGGATGGTTCGCCTTCAGAAATTGCCGAATCATACCGTCAACACTTCCAAGAAATATTGGTCGATGAGTATCAAGATACGAACCGAGTTCAAGAGAAAATACTATCTTGCATCAAAACGGGTGATGAACATAATGGTAATTTATTTATGGTTGGAGATGTTAAGCAATCCATTTATAAATTTAGACAAGCTGATCCAAGTTTATTTATTGAAAAGTATCAACGCTTTACTATAGATGGAGATGGCACTGGACGTCGAATTGATTTGTCGCAAAACTTCCGTTCTCGAAAAGAAGTACTGTCAACGACTAACTATATATTCAAACATATGATGGATGAACAAGTCGGTGAAGTAAAATATGATGAAGCGGCACAGTTGTATTATGGTGCACCATATGATGAATCGGACCATCCAGTAAACTTAAAAGTCCTTGTTGAAGCGGATCAAGAACATAGTGATTTAACTGGTAGTGAACAAGAAGCGCATTTTATAGTAGAACAAGTTAAAGATATCTTAGAACATCAAAAAGTTTATGATATGAAAACAGGAAGCTATAGAAGTGCGACATACAAGGATATCGTTATTCTAGAACGCAGCTTTGGACAAGCTCGCAATTTACAACAAGCCTTTAAAAATGAAGATATTCCATTCCATGTGAATAGTCGTGAAGGTTACTTTGAACAAACAGAAGTCCGCTTAGTATTATCATTTTTAAGAGCGATAGATAATCCATTACAAGATATTTATTTAGTTGGGTTAATGCGCTCCGTTATATATCAGTTCAAAGAAGACGAATTAGCTCAAATTAGAATATTGAGTCCAAATGATGACTACTTCTATCAATCGATTGTAAATTACATTAATGACGAAGCAGCAGATGCAATTTTAGTTGATAAATTAAAAATGTTTTTATCAGATATTCAAAGTTACCAACAATATAGTAAAGATCATCCGGTGTATCAGTTAATTGATAAATTTTATAATGATCATTATGTTATTCAATACTTTAGTGGACTTATTGGTGGACGTGGACGACGTGCAAATCTTTATGGTTTATTTAATAAAGCTATCGAGTTTGAGAATTCAAGTTTTAGAGGTTTATATCAATTTATTCGTTTTATCGATGAATTGATTGAAAGAGGCAAAGATTTTGGTGAGGAAAATGTAGTTGGTCCAAACGATAATGTCGTTAGAATGATGACAATTCATAGTAGTAAAGGTCTAGAGTTTCCATTTGTCATTTATTCTGGATTGTCAAAAGATTTTAATAAACGTGATTTGAAACAACCAGTTATTTTAAATCAGCAATTTGGTCTCGGAATGGATTATTTTGATGTGGATAAAGAAATGGCATTTCCATCTTTAGCTTCGGTTGCATATAGAGCTGTTGCCGAAAAAGAACTTGTGTCAGAAGAAATGCGATTAGTCTATGTAGCATTAACAAGAGCGAAAGAACAACTTTATTTAATTGGTAGAGTGAAAAATGATAAATCATTACTAGAACTAGAGCAATTGTCTATTTCTGGTGAGCACATTGCTGTCAATGAACGATTAACTTCACCAAATCCGTTCCATCTTATTTATAGTATTTTATCTAAACATCAATCTGCGTCAATTCCAGATGATTTAAAATTTGAAAAAGATATAGCACAAATTGAAGATAGTAGTCGTCCGAATGTAAATATTTCAATTGTGTACTTTGAAGATGTGTCTACAGAAACCATTTTAGATAATGATGAATATCGTTCGGTTAATCAATTAGAAACTATGCAAAATGGTAATGAAGATGTTAAAGCACAAATTAAACACCAACTTGATTATCGATATCCATATGTAAATGATACTAAAAAGCCCTCAAAACAATCTGTTTCTGAATTGAAAAGACAATATGAAACAGAAGAAAGTGGCACAAGTTACGAACGAGTAAGGCAATATCGTATCGGTTTTTCAACGTATGAACGACCTAAATTTCTAAGTGAACAAGGTAAACGAAAAGCGAATGAAATTGGTACGTTAATGCATACAGTGATGCAACATTTACCATTCAAAAAAGAACGCATATCTGAAGTTGAGTTACATCAGTATATCGATGGATTAATCGATAAACATATTATCGAAGCAGATGCGAAAAAAGATATCCGTATGGATGAAATAATGACATTTATCAATAGTGAGTTATATTCGATTATTGCTGAAGCAGAGCAAGTTTATCGTGAATTACCGTTTGTAGTTAACCAAGCATTAGTTGACCAATTGCCACAAGGAGACGAAGACGTCTCAATTATTCAAGGTATGATTGACTTAATCTTTGTTAAAGATGGTGTGCATTATTTTGTAGACTATAAAACCGATGCATTTAATCGTCGCCGTGGGATGACAGATGAAGAAATTGGTACACAATTAAAAAATAAATATAAGATACAGATGAAATATTATCAAAATACGCTTCAAACGATTCTTAATAAAGAAGTTAAAGGTTATTTATACTTCTTCAAATTTGGTACATTGCAACTATAGstoptattttgattttcaaaagaataaaaaataatttcgattaagtgcaaagtccttgtagcagaatgaacacaactcattttcaaaattgtcttacttatttatttgttatttgataacgaaaaaagttataatgtgaattaagataaagatgaggagttgagaatgaatgaaattcttatcattcaagtataatgacaaaacttcatatggcgttaaagtaaaacgcgaagatgctgtatgggatttaacacaagtatttgctgactttgcagaaggagatttccatcctaaaacattgttagctggtttacaacaaaatcatactttagattttcaagaacaagtacgtaaagcagttgtagcagcagaagatagcggcaaagctgaagactataaaatttcatttaatgacattgaatttttaccaccagtaacacctccgaataatgtgattgcttttggtagaaattacaaagatcatgcgaacgaattaaatcatgaagtggaaaaattatatgtatttacaaaagcagcgtcatctttaacaggagataatgcaacaattccaaatcataaagatattactgatcaattagattatgaaggtgaattaggtattgttattggtaagtctggtgaaaagattccaaaagcattagctttagattatgtttacggctatacaattattaacgatatcactgatcgcaaagcacaaagtgaacaagatcaagcatttttatcaaaaagtttaactggcggttgcccaatgggtccttatatcgttactaaagacgaactaccattacctgaaaatgtaaatattgttacaaaagttaacaatgaaattagacaagatggtaacactggcgaaatgattcttaaaattgatgaattaatagaagaaatttcaaaatatgttgcactacatccgggagatattattgcaactggtacaccagcaggcgttggtgcaggtatgcaaccacctaaatttttac